Antigen Record Ag000154

AgACCAg000154
Date11-02-2007
Last updated14-12-2016
Antigen NameMUC1
Common NameMucin or MUC1
Full NameCarcinoma-associated mucin
SynonymBreast carcinoma-associated antigen DF3; CD227 antien; DF3 antigen; H23 antigen CD227; EMA; Epsialin; H23AG; MAM6; MUC-1; MUC1; MUC-1/SEC; MUC-1/X; MUC-1/Y; MUC-1/Z; MUC-1/ZD; PEM; PEMT; PUM; episialin

another display format
  • Breast carcinoma-associated antigen DF3
  • CD227 antien
  • DF3 antigen
  • H23 antigen CD227
  • EMA
  • Epsialin
  • H23AG
  • MAM6
  • MUC-1
  • MUC1
  • MUC-1/SEC
  • MUC-1/X
  • MUC-1/Y
  • MUC-1/Z
  • MUC-1/ZD
  • PEM
  • PEMT
  • PUM
  • episialin
UniProt IDP15941
NCBI Gene ID4582
GeneCard IDGC01M155158
CommentThis is a splice isoform.
AnnotationThis is a full length sequence.
IsoformsAg000155,  Ag000156,  Ag000157,  Ag000158,  Ag000159,  Ag000160,  Ag000161,  Ag000162,  Ag000194,  Ag001842,  Ag001843,  Ag001844,  Ag001845,  Ag001846,  Ag001847,  Ag001848,  Ag001849,  Ag001850,  Ag001851,  Ag001852,  Ag001853,  Ag001854,  Ag001855,  Ag001856,  Ag001857,  Ag001858,  Ag001859,  Ag001860,  Ag001861,  Ag001862

Alignment of all Isoforms
Mutation entriesAg003564

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RNA/protein expression profileRNA and protein Expression profile
T cell epitopeEpitope sequencePositionHLA alleleReference
LLLLTVLTV12-20 A*0201  10361129
PGSTAPPAHGVT128-139,  148-159,  168-179,  188-199,  208-219,  228-239,  248-259,  268-279,  288-299,  308-319,  328-339,  348-359,  368-379,  388-399,  408-419,  428-439,  448-459,  468-479,  488-499,  508-519,  528-539,  548-559,  568-579,  588-599,  608-619,  628-639,  648-659,  668-679,  688-699,  708-719,  728-739,  748-759,  768-779,  788-799,  808-819,  828-839,  848-859,  868-879,  888-899,  908-919,  928-939 DR3  9823312
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STAPPAHGV130-138,  150-158,  170-178,  190-198,  210-218,  230-238,  250-258,  270-278,  290-298,  310-318,  330-338,  350-358,  370-378,  390-398,  410-418,  430-438,  450-458,  470-478,  490-498,  510-518,  530-538,  550-558,  570-578,  590-598,  610-618,  630-638,  650-658,  670-678,  690-698,  710-718,  730-738,  750-758,  770-778,  790-798,  810-818,  830-838,  850-858,  870-878,  890-898,  910-918,  930-938 A*0201  10361129
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STAPPVHNV950-958 A*0201  10361129
TLAPATEPA79-87 A*0201  11169964
HLA ligandLigand SequencePositionHLA alleleReference
APDTRPAP141-148,  161-168,  181-188,  201-208,  221-228,  241-248,  261-268,  281-288,  301-308,  321-328,  341-348,  361-368,  381-388,  401-408,  421-428,  441-448,  461-468,  481-488,  501-508,  521-528,  541-548,  561-568,  581-588,  601-608,  621-628,  641-648,  661-668,  681-688,  701-708,  721-728,  741-748,  761-768,  781-788,  801-808,  821-828,  841-848,  861-868,  881-888,  901-908,  921-928 A*0201  9548459
NLTISDVSV1133-1141 A*0201  9548459
Predicted HLA binders
Allele:  predictions
Peptide length:   
Antigen sequenceMTPGTQSPFFLLLLLTVLTVVTGSGHASSTPGGEKETSATQRSSVPSSTEKNAVSMTSSVLSSHSPGSGS
STTQGQDVTLAPATEPASGSAATWGQDVTSVPVTRPALGSTTPPAHDVTSAPDNKPAPGSTAPPAHGVTS
APDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGS
TAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTS
APDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGS
TAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTS
APDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGS
TAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTS
APDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGS
TAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTS
APDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGS
TAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTS
APDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGS
TAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDNRPALGSTAPPVHNVTSASGSASGSASTLVHNGTSAR
ATTTPASKSTPFSIPSHHSDTPTTLASHSTKTDASSTHHSSVPPLTSSNHSTSPQLSTGVSFFFLSFHIS
NLQFNSSLEDPSTDYYQELQRDISEMFLQIYKQGGFLGLSNIKFRPGSVVVQLTLAFREGTINVHDVETQ
FNQYKTEAASRYNLTISDVSVSDVPFPFSAQSGAGVPGWGIALLVLVCVLVALAIVYLIALAVCQCRRKN
YGQLDIFPARDTYHPMSEYPTYHTHGRYVPPSSTDRSPYEKVSAGNGGSSLSYTNPAVAAASANL